Doorgaan naar hoofdnavigatie Doorgaan naar zoeken Ga verder naar hoofdinhoud

Fast selection of miRNA candidates based on large-scale pre-computed MFE sets of randomized sequences.

Jan Peter Nap

Onderzoeksoutput: ArticleAcademicpeer review

154 Downloads (Pure)

Samenvatting

Small RNAs are important regulators of genome function, yet their prediction in genomes is still a major computational challenge. Statistical analyses of pre-miRNA sequences indicated that their 2D structure tends to have a minimal free energy (MFE) significantly lower than MFE values of equivalently randomized sequences with the same nucleotide composition, in contrast to other classes of non-coding RNA. The computation of many MFEs is, however, too intensive to allow for genome-wide screenings.
Originele taal-2English
Aantal pagina's10
TijdschriftBMC Research Notes
StatusPublished - 13 jan. 2014

Duurzame ontwikkelingsdoelstellingen van de VN

Deze output draagt bij aan de volgende duurzame ontwikkelingsdoelstelling(en)

  1. SDG 07 – Betaalbare en schone energie
    SDG 07 – Betaalbare en schone energie
  2. SDG 09 – Industrie, innovatie en infrastructuur
    SDG 09 – Industrie, innovatie en infrastructuur

Keywords

  • moleculaire technieken

Research Focus Areas Hanze University of Applied Sciences

  • Energie

Research Focus Areas Research Centre or Centre of Expertise

  • Hernieuwbare brandstoffen en duurzame gassen

Publinova thema's

  • Techniek

Vingerafdruk

Duik in de onderzoeksthema's van 'Fast selection of miRNA candidates based on large-scale pre-computed MFE sets of randomized sequences.'. Samen vormen ze een unieke vingerafdruk.

Citeer dit