De Stichting Nationale Koolstofmarkt borgt de kwaliteit van de koolstofcertificaten, zodat de markt erop kan vertrouwen dat de emissiereductie of koolstofvastlegging die op het certificaat staat ook daadwerkelijk is behaald. SNK heeft hiervoor een set aan methoden vastgesteld voor verschillende project-typen voor het berekenen van emissie-reducties (het ‘Rulebook’). Projectpartijen gebruiken deze methoden bij het opstellen van een projectplan dat door SNK wordt gevalideerd. Projecten met een gevalideerd projectplan kunnen van start en emissies reduceren. De behaalde emissiereductie wordt door onafhankelijke deskundigen geverifieerd. Voor geverifieerde reducties geeft SNK certificaten uit aan de projectpartijen.
SNK is een onafhankelijke entiteit, d.w.z. de methodedocumenten en regels worden alleen door het bestuur van SNK, met onafhankelijke bestuursleden, vastgesteld, zonder formele betrokkenheid daarin en invloed daarop van derden, Rijksoverheid noch publieke en private partijen.